发酵罐搅拌器主要的作用是促进发酵过程中的物质混合和分散。在发酵过程中，需要有良好的气体、食物和水的混合才能使微生物得到足够的营养和氧气，从而促进其繁殖和代谢产生发酵产物。发酵罐搅拌器通过将罐内液体强制对换，使深层液体与表层交换，从而保证各层物质能够均匀分布。同时，搅拌器还可提高发酵物料的传热效率，促进产物的均匀分布，防止发酵产物沉积或结块，使反应速率提高，促进发酵反应的进行。
