1、性質不同:衞健委即國家衞生健康委員會是國務院組成部門,為正部級。衞生局是地方各級醫院的主管部門。2、職責不同:衞健委貫徹落實黨中央關於衞生健康工作的方針政策和決策部署,在履行職責過程中堅持和加強黨對衞生健康工作的集中統一領導。