《金陵十三釵》是一部描寫清朝末年慈禧太后統治期間的故事。影片主要講述了慈禧太后命令宮女選美，以便為她尋找一個合適的貴妃，從而達到掌握權力的目的。在這場選美中，共有13位宮女參加，她們都是各自的家族送來的人，並在宮中接受熬煉。
影片中，太監李蓮英成為了宮中“四小花旦”之一，而她的家族則成為了所有家族中的佼佼者。與此同時，第一次參加選美的宮女綴春也獲得了慈禧太后的青睞，因為她的清純與善良。不過，宮中卻掀起了一股深藏不露的爭鬥，宮女之間互相嫉妒，對待別人的手段十分殘忍，從而使得宮中物品失竊、人員傷亡等情況頻發。
影片的高潮是在抵制外國侵略的戰爭中發生的。由於清國皇帝宣佈開會，慈禧太后因此掌握了大權。然而，在宮中卻發生了一起事件，太監小丫頭盈盈被宮中最尊貴的老太監李蓮英一刀捅死。此事給宮中的局勢帶來了極大的震動，所有宮女間的紛爭因此達到了頂點。此時，來自外面的敵人已經進攻到了京城，與此同時，太監們也在用自己的方式為皇族們保護着宮廷。
最終，在宮中的混亂中，綴春、富貴、梅香等宮女勇敢站出來反對畏縮、爭權奪利、傾軋相爭的局面。她們以自己的方式保護了皇城，維護了皇族們的權益。在劇情的高潮部分，太監們齊心協力，與外敵進行了激烈的戰鬥。雖然她們戰鬥力量不足，但她們的愛國精神感染了所有人，防守京城的士兵們也被鼓舞起來，在太監的號召下勇敢地使用自己的身體實現了最終的勝利。影片以一幅英勇無畏的場面為結尾，生動地表現了太監們對祖國的熱愛和堅定的信仰。
