1、原料不同。雖説桂枝和肉桂都是來自於桂樹，但是它們的來源部位區別很大。桂枝：其主要原料是桂樹的嫩枝，經過乾製切片後製成的一種中藥。肉桂：其是以桂樹的主幹，去掉外面的老皮，取其枝幹部位的嫩皮做成的中藥。
2、用途不同。桂枝：其用於做中藥為主，常作為風寒感冒等外解表的藥物食用，少用於做食材。桂枝：其與桂皮的功效差不多，雖然説也可以用來做中藥，但是大多數還是用來做調味品，以食材為主。
3、功效不同。桂枝：其在臨牀上主要是用來治療上感風寒，因為桂枝性温，歸心、肺、膀胱經，輕而走上。肉桂：其在臨牀上主要是用來治療陽衰與裏寒重症，因為肉桂性熱，歸心、肝、腎、脾四經，性沉而入下。
