1、長度不同
蟒蛇最大全長（3.17+0.386）米。水蚺是現存蛇類中最大的一種，最大能長到10米，初生仔蛇長70-80㎝。
2、繁衍方式不同
蟒蛇屬於蟒科，蟒科多是卵生的；每次產卵數8-103枚，卵為白色，孵化55-61天即破殼。
而水蚺屬於蚺科，蚺科多是卵胎生的，雌水蟒將受精卵保留在身體內直到孵化，每次可出生10-70多隻小水蟒。
3、分佈範圍不同
蟒蛇是東南亞地區廣佈的物種，棲居於熱帶、亞熱帶低山叢林中，需要常綠闊葉林或常綠闊葉藤本灌木叢，以及良好的洞穴供休息及隱蔽，分佈在世界各地，但各分佈地區均普遍有所下降。
水蚺生活在南美洲熱帶地區河流附近及其他水體中。主要分佈於世界各地的沼澤地區，其中體型最大的一種-綠森蚺分佈於南美洲熱帶雨林深處，可以解除水來掩護自己。在亞馬遜河中也有零星分佈。
